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[FAQ] Perl在生物信息中的用途

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发表于 2012-7-9 20:33 | 显示全部楼层 |阅读模式
最近在学习Perl语言
发现Perl只能单行读入、处理文本

想了解下Perl在生物信息学中主要都用在什么处理上,或者叫什么功能上。
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发表于 2012-7-9 23:21 | 显示全部楼层
其实吧,perl有被python取代的趋势,至少最近的paper里已经没人用perl了
perl在bioinfo的地位,很大一部分是靠CPAN上的资源,但python已经开始后来居上了
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发表于 2012-7-9 23:28 | 显示全部楼层
寇强 发表于 2012-7-9 23:21
其实吧,perl有被python取代的趋势,至少最近的paper里已经没人用perl了
perl在bioinfo的地位,很大一部分 ...

bioperl,以往的积累不容易被替代吧

什么时候搞个biopython?
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发表于 2012-7-9 23:42 | 显示全部楼层
tigerfish 发表于 2012-7-9 23:28
bioperl,以往的积累不容易被替代吧

什么时候搞个biopython?

biopython一直就有,而且现在的目标就是取代bioperl
perl以前学过,读别人写的代码太困难了
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 楼主| 发表于 2012-7-10 08:13 | 显示全部楼层
寇强 发表于 2012-7-9 23:21
其实吧,perl有被python取代的趋势,至少最近的paper里已经没人用perl了
perl在bioinfo的地位,很大一部分 ...

那意思是转学python?
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发表于 2012-7-10 08:47 | 显示全部楼层
1052382576 发表于 2012-7-10 08:13
那意思是转学python?

这种论断我就不敢随便说了
现在的确有这种趋势
另一个原因是perl我真的学不下去,但python入门非常快,而且对正则的支持也足够好
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 楼主| 发表于 2012-7-10 09:51 | 显示全部楼层
寇强 发表于 2012-7-10 08:47
这种论断我就不敢随便说了
现在的确有这种趋势
另一个原因是perl我真的学不下去,但python入门非常快, ...

看来得学习python了
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发表于 2012-7-10 09:59 | 显示全部楼层
1052382576 发表于 2012-7-10 09:51
看来得学习python了

我是先学python,之后就不想学别的了
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发表于 2013-5-14 08:57 | 显示全部楼层
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发表于 2013-10-4 04:07 | 显示全部楼层
bioperl is on top of perl, and >1000 modules make perl more powerful than python/biopython. Yes, python is easier to dive in, but you will feel the disadvantage as compared with perl. My feeling is to have both. No skill would ever overload you!
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